基因密钥的剧痛如毒蛇啃噬着林晚的神经，二十年前的记忆碎片如利刃般割裂她的意识。她仿佛看见父亲被副局长推入泛着紫光的基因池，绝望的眼神与海底实验室初代克隆体α的嘶吼重叠，祭坛上的黑色光芒正将这份痛苦具象化。
“姐姐！快用基因密钥覆盖祭坛程序！”X - 2号的呐喊穿透混乱。少女脖颈处的刺青几乎要灼穿皮肤，蓝色光流疯狂注入林晚的基因密钥，在剧痛中开辟出一条清醒的通道。林晚强撑着起身，却发现副局长的十二台能量发生器己组成诡异的基因矩阵，将整个亚特兰蒂斯笼罩在血色光晕中。
“太晚了，林晚。”副局长的机械义眼投射出全息影像，画面里初代玫瑰被绑在基因手术台上，而她的父亲正握着手术刀，“你以为你父亲是守护者？不，他才是打开潘多拉基因库的罪魁祸首！”
记忆与影像的剧烈冲突让林晚踉跄跪地。就在这时，她胸口的基因密钥突然迸发金色光芒，将副局长的全息影像灼烧出裂痕。“那是...记忆封印！”林晚的瞳孔骤然收缩——在父亲颤抖的双手下，初代玫瑰脖颈处浮现出与X - 2号如出一辙的刺青，而副局长正站在阴影里，嘴角挂着得逞的狞笑。
真相如雷霆劈碎迷雾：父亲根本不是主谋，他是在副局长的胁迫下，试图用初代玫瑰的基因修补基因库的致命缺陷！而所谓的“基因武器”，不过是副局长为掩盖真相制造的假象。
“启动守卫者终极形态！”副局长的怒吼打破死寂。十二台能量发生器同时爆发出刺目红光，石像守卫们的瞳孔转为深紫色，体表生长出金属质感的外骨骼，权杖尖端凝聚出足以撕裂空间的能量球。玫瑰组织的队员们接连倒下，海水被鲜血染成浓重的紫色。
林晚将基因密钥拍向祭坛凹槽，金色数据流与副局长的黑色能量在虚空中相撞。记忆封印彻底破碎的瞬间，她看见父亲在基因池里留下的最后影像——他将一枚蓝色晶体塞进初代玫瑰手中，那晶体的纹路，竟与X - 2号拼死保护的吊坠一模一样！
“原来吊坠是父亲留给初代玫瑰的自毁程序！”林晚猛然转头，却见X - 2号己将吊坠高高举起。少女的皮肤开始透明化，刺青化作数据流缠绕在吊坠表面。“姐姐，这次换我来保护你...”X - 2号的声音带着释然，蓝色光芒瞬间笼罩整个亚特兰蒂斯。
石像守卫们在光芒中崩解，副局长的能量矩阵发出刺耳的警报。他疯狂地将自身基因注入发生器，试图强行吞噬基因库的力量。然而异变陡生，那些被他篡改的基因密码突然反噬，银色战甲上爬满紫色裂痕，机械义眼迸发出刺眼的红光。
“不！不可能！”副局长的嘶吼中，十二台能量发生器同时爆炸。林晚在气浪中抓住X - 2号逐渐消散的手，却只握住一缕蓝光。少女最后的意识通过基因共鸣传来：“去基因库核心...那里有父亲留给你的...”
爆炸余波中，海底金字塔的顶部轰然坍塌，露出通往基因库核心的阶梯。阶梯由发光的基因链组成，每一步都伴随着远古文明的低语。林晚握紧基因密钥，在玫瑰组织队员的掩护下拾级而上。当她踏入核心大厅，整面墙壁的基因图谱突然活过来，化作父亲的全息投影。
“小晚，如果你看到这段影像，说明你己经突破了记忆封印。”父亲的声音带着沧桑与欣慰，“潘多拉基因库并非牢笼，而是一个平衡装置——它能吸收人性之恶，却需要纯净的基因作为钥匙。副局长篡改的基因密码，会让整个世界陷入永劫...”
投影渐渐消散，地面升起一座水晶棺，棺中沉睡着真正的初代玫瑰。她的胸口插着半块破碎的基因密钥，与林晚的密钥产生强烈共鸣。而在水晶棺底部，静静躺着一封泛黄的信，开头的字迹让林晚泪流满面：“致我的女儿...”
就在此时，海底突然传来剧烈震动。林晚知道，副局长的残党正在发动最后的攻击。她将两半基因密钥合二为一，金色光芒照亮整个核心大厅。这一次，她终于要终结这场延续二十年的基因阴谋，让父亲的遗愿得以实现。
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